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我国科研团队发布水稻完好参阅基因组
发布时间:2024-04-02 02:16:52 作者: 欧宝软件

  水稻是重要的粮食作物,其基因组拼装对水稻育种含义严重。23日,记者从我国农业科学院深圳农业基因组研讨所得悉,该所联合崖州湾实验室、我国水稻研讨所、我国农科院作物科学研讨所和扬州大学等多个单位发布完好的水稻参阅基因组,完结了全基因组一切染色体端粒到端粒无缺口拼装,为水稻育种研讨供给了新的有力东西和重要大数据根底。相关研讨成果日前宣布在《分子植物》(Molecular Plant)上。

  2005年,水稻种类“日本晴”基因组草图发布,水稻研讨正式跨入基因组学年代。

  尔后,“日本晴”参阅基因组在2013年进一步更新,大幅改进了基因组拼装成果和基因注释,成为水稻的规范参阅基因组,一向沿用至今。但是,因为其时测序和拼装技能约束,该基因组对杂乱结构区域的拼装存在占全长3%左右的缺口,这些缺口阻止了水稻育种的研讨进程。

  论文通讯作者、我国农业科学院深圳农业基因组研讨所研讨员商连光介绍,为此,研讨团队以水稻“日本晴”为资料,综合使用新一代测序技能,完结了“日本晴”参阅基因组的完好拼装,其巨细为385.7百万碱基对,每条染色体的端粒到端粒均由一条完好接连的序列组成,碱基精确度超越99.9999%,最新的拼装新增了12.5百万碱基对的基因组序列,首要解锁了水稻基因组中结构最为杂乱的核糖体DNA序列、着丝粒区域、杂乱转座子序列和端粒区域等,批改了多个因为缺口导致的基因结构过错,新增了1324个蛋白编码基因注释,该研讨为水稻育种研讨奠定了重要理论根底。(马爱平 马昕怡)

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